L’Île-du-Prince-Édouard a été l’une des premières provinces du Canada à offrir le programme Racines de l’empathie. Il y a débuté à l’automne 2000 dans neuf classes réparties dans la province. À ce jour, Racines de l’empathie a bénéficié à plus de 3 175 enfants dans toute la province.

Au cours des dix dernières années, 125 bébés participant au programme sont devenus les plus jeunes enseignants de l’Île-du-Prince-Édouard. Un nombre équivalent de parents bénévoles ont pu en apprendre davantage sur leur bébé et sur le rôle clé qu’ils jouent eux-mêmes dans le développement de leur enfant. Des centaines d’enseignantes de l’Île-du-Prince-Édouard ont découvert la vie affective de leurs élèves et étaient aux premières loges pour constater à quel point l’enseignement des compétences sociales et émotionnelles est important pour les enfants. Les programmes de l’île reçoivent le soutien de La fondation de la famille J.W. McConnell.

Dans l’Île-du-Prince-Édouard, le programme est dispensé en anglais et en français, en milieu urbain, rural et isolé, y compris dans des communautés autochtones. Un programme est actuellement en cours dans la communauté des Premières Nations de Lennox Island et un autre à Mt. Stewart, où les Micmacs sont nombreux.
 
En 2010-2011, six programmes Racines de l’empathie sont donnés dans six écoles de deux districts scolaires.